وأرجع سبب حريق المدرسة إلى سقوط زجاجات المولوتوف بداخلها، مما أدى إلى حريق بعض محتوياتها ومستلزمات المدرسة، ونشوب حريق بداخل إحدى الغرف داخل المدرسة التى تحتوى على بعض الأدوات المدرسية.

يذكر أن المدرسة تعرضت لسرقة محتوياتها بالكامل أثناء إحياء ذكرى أحداث محمد محمود، وتم نقل طالباتها لمدرسة عابدين الثانوية بنات.